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        <BiographicalNote language="fre">&lt;p class="MsoNormal"&gt;&lt;b&gt;&lt;span style="font-family:Roboto"&gt;Denis Tagu&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style="font-family:Roboto"&gt;, directeur de recherche à l’Inra, s’intéresse au fonctionnement des génomes (notamment ceux des insectes) pour comprendre comment les organismes s’adaptent à leur environnement.&lt;o:p&gt;&lt;/o:p&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
        <BiographicalNote language="eng">&lt;p&gt;Denis Tagu, docteur ès sciences, est directeur de recherches à l'Inra. Il a notamment&lt;br /&gt;développé des ressources génomiques sur les insectes ravageurs des cultures&lt;br /&gt;(les pucerons), nécessitant l’appui d’outils d’analyse de stockage et de visualisation&lt;br /&gt;apportés par la bioinformatique. Il a été coordinateur de Principes des techniques de&lt;br /&gt;biologie moléculaire publié chez Inra Éditions, traduit en anglais, espagnol et chinois.&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
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        <BiographicalNote>&lt;p&gt;Jean-Loup Risler, docteur ès sciences, ex-directeur de recherches au CNRS, a fait ses premières armes au Centre de génétique moléculaire de Gif-sur-Yvette. Il a ensuite étudié la cristallographie des protéines avant de s'orienter, une dizaine d’années plus tard, vers l’analyse in silico des séquences biologiques à Gif-sur-Yvette, puis à Versailles et enfin à Evry.&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
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        <SubjectHeadingText>|Sciences de la vie et de la terre|Techniques et méthodes</SubjectHeadingText>
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        <Text language="fre">&lt;p&gt;&lt;b&gt;Cet ouvrage en impression à la demande sera envoyé sous 3 semaines environ (France métropolitaine) et dans un colis séparé en cas de commande avec un autre livre papier.&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Située à l'interface entre la biologie et l'informatique, la bio-informatique et ses outils font aujourd'hui partie du « paysage » des laboratoires s’intéressant de près ou de loin à la structure, au fonctionnement et à l’évolution des génomes. Pour tous les intervenants, s’approprier les outils d’analyse, de stockage et de visualisation des séquences d’acides nucléiques et d’acides aminés est devenu une nécessité. Ce livre contribuera à une meilleure compréhension des outils à disposition et de leurs principes de fonctionnement et permettra ainsi d’en faire un usage raisonné.&lt;/p&gt;</Text>
        <Text language="eng">&lt;p&gt;&lt;b&gt;This Print On Demand book will be sent within 3 weeks (metropolitan France) and in a separate package if you order another paperback book.&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;At the interface between biology and computer science, bioinformatics and its tools are now part of the "landscape" of laboratories interested in any way whatsoever in the structure, operation and evolution of genomes. Everyone involved now finds it necessary to use tools for analysing, storing and visualising nucleic acid and amino acid sequences. This book will assist in understanding bioinformatics tools and their operating principles better, thereby allowing reasoned use of them.&lt;/p&gt;</Text>
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        <Text>Ce livre contribuera à une meilleure compréhension des outils mis à disposition par la bio-informatique et de leurs principes de fonctionnement et permettra ainsi aux biologistes d'en faire un usage raisonné.</Text>
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        <Text>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Avant-propos&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;G&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 1. Bio-informatique et bio-analyse : d&amp;eacute;finitions&lt;br /&gt;Fiche 2. Quelques g&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s sur les g&amp;egrave;nes et les g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;&amp;nbsp;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Banques et bases de donn&amp;eacute;es en biologie&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 3. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 4. Banques g&amp;eacute;n&amp;eacute;ralistes&lt;br /&gt;Fiche 5. Bases de donn&amp;eacute;es sp&amp;eacute;cialis&amp;eacute;es de g&amp;eacute;nomes complets&lt;br /&gt;Fiche 6. Bases de donn&amp;eacute;es d&amp;eacute;di&amp;eacute;es aux exp&amp;eacute;riences &amp;agrave; grande &amp;eacute;chelle&lt;br /&gt;Fiche 7. Bases de donn&amp;eacute;es d&amp;eacute;di&amp;eacute;es &amp;agrave; des familles de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 8. G&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s sur les outils de recherche, d&amp;#39;analyse et de visualisation&lt;br /&gt;Fiche 9. Outils d&amp;rsquo;interrogation de donn&amp;eacute;es : &lt;em&gt;databank browsers &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Fiche 10. Outils de navigation g&amp;eacute;nomique : &lt;em&gt;genome browsers &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Alignement des s&amp;eacute;quences&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 11. Principes&lt;br /&gt;Fiche 12. Alignements graphiques et programmation dynamique&lt;br /&gt;Fiche 13. BLAST&lt;br /&gt;Fiche 14. Statistiques de BLAST et E-value&lt;br /&gt;Fiche 15. Pi&amp;egrave;ges de BLAST&lt;br /&gt;Fiche 16. Filtrage des s&amp;eacute;quences et recherche de motifs avec BLAST&lt;br /&gt;Fiche 17. Diff&amp;eacute;rentes variantes de BLAST&lt;br /&gt;Fiche 18. FASTA&lt;br /&gt;Fiche 19. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Fiche 20. Principales m&amp;eacute;thodes d&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Fiche 21. Alignement multiple : ClustalW&lt;br /&gt;Fiche 22. Alignement multiple : ClustalW en ligne de commande&lt;br /&gt;Fiche 23. Alignement multiple : DIALIGN&lt;br /&gt;Fiche 24. Alignement multiple : T-Coffee&lt;br /&gt;Fiche 25. Alignement multiple : MUSCLE&lt;br /&gt;Fiche 26. Alignement multiple : MAFFT&lt;br /&gt;Fiche 27. Choix d&amp;rsquo;un logiciel d&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Domaines prot&amp;eacute;iques&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 28. Domaines, modules ou motifs prot&amp;eacute;iques et leurs bases de donn&amp;eacute;es&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Reconstruction phylog&amp;eacute;n&amp;eacute;tique&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 29. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 30. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur les matrices de distances&lt;br /&gt;Fiche 31. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur le principe de parcimonie&lt;br /&gt;Fiche 32. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur le maximum de vraisemblance&lt;br /&gt;Fiche 33. Estimation de la robustesse&lt;br /&gt;Fiche 34. Choix d&amp;rsquo;une m&amp;eacute;thode&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Annotation des g&amp;eacute;nomes&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 35. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 36. Pr&amp;eacute;diction des s&amp;eacute;quences codantes et cha&amp;icirc;nes de Markov&lt;br /&gt;Fiche 37. Annotation structurale, ou syntaxique&lt;br /&gt;Fiche 38. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle&lt;br /&gt;Fiche 39. Limites de l&amp;rsquo;annotation des g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;Fiche 40. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Fiche 41. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico&lt;/em&gt;&amp;nbsp; par recherche d&amp;rsquo;homologies&lt;br /&gt;Fiche 42. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: alignement de paires de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 43. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: alignement multiple de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 44. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: m&amp;eacute;thodes de reconnaissance par repliements&lt;br /&gt;Fiche 45. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: conservation de la fonction et similarit&amp;eacute; de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 46. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: propri&amp;eacute;t&amp;eacute;s intrins&amp;egrave;ques des s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 47. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: exploitation du contexte des g&amp;egrave;nes&lt;br /&gt;Fiche 48. Conclusions sur l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Comparaison des g&amp;eacute;nomes&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 49. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 50. &amp;Eacute;v&amp;eacute;nements de sp&amp;eacute;ciation et de duplication&lt;br /&gt;Fiche 51. Orthologie et paralogie&lt;br /&gt;Fiche 52. Processus de comparaison des g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;Fiche 53. Classification des esp&amp;egrave;ces tenant compte de leur contenu g&amp;eacute;n&amp;eacute;tique&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Analyse du transcriptome&lt;br /&gt;&lt;/strong&gt;Fiche 54. D&amp;eacute;finition des s&amp;eacute;quences sonde pour la PCR et pour les puces &amp;agrave; ADN&lt;br /&gt;Fiche 55. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome&lt;br /&gt;Fiche 56. M&amp;eacute;thodes de l&amp;rsquo;analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome&lt;br /&gt;Fiche 57. Analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome : signification statistique&lt;br /&gt;Fiche 58. Analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome : repr&amp;eacute;sentations graphiques&lt;br /&gt;Pour en savoir plus...&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Coordonn&amp;eacute;es des auteurs&lt;br /&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;</Text>
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        <BiographicalNote language="fre">&lt;p class="MsoNormal"&gt;&lt;b&gt;&lt;span style="font-family:Roboto"&gt;Denis Tagu&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style="font-family:Roboto"&gt;, directeur de recherche à l’Inra, s’intéresse au fonctionnement des génomes (notamment ceux des insectes) pour comprendre comment les organismes s’adaptent à leur environnement.&lt;o:p&gt;&lt;/o:p&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
        <BiographicalNote language="eng">&lt;p&gt;Denis Tagu, docteur ès sciences, est directeur de recherches à l'Inra. Il a notamment&lt;br /&gt;développé des ressources génomiques sur les insectes ravageurs des cultures&lt;br /&gt;(les pucerons), nécessitant l’appui d’outils d’analyse de stockage et de visualisation&lt;br /&gt;apportés par la bioinformatique. Il a été coordinateur de Principes des techniques de&lt;br /&gt;biologie moléculaire publié chez Inra Éditions, traduit en anglais, espagnol et chinois.&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
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        <BiographicalNote>&lt;p&gt;Jean-Loup Risler, docteur ès sciences, ex-directeur de recherches au CNRS, a fait ses premières armes au Centre de génétique moléculaire de Gif-sur-Yvette. Il a ensuite étudié la cristallographie des protéines avant de s'orienter, une dizaine d’années plus tard, vers l’analyse in silico des séquences biologiques à Gif-sur-Yvette, puis à Versailles et enfin à Evry.&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
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        <Text language="fre">&lt;p&gt;&lt;b&gt;Cet ouvrage en impression à la demande sera envoyé sous 3 semaines environ (France métropolitaine) et dans un colis séparé en cas de commande avec un autre livre papier.&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Située à l'interface entre la biologie et l'informatique, la bio-informatique et ses outils font aujourd'hui partie du « paysage » des laboratoires s’intéressant de près ou de loin à la structure, au fonctionnement et à l’évolution des génomes. Pour tous les intervenants, s’approprier les outils d’analyse, de stockage et de visualisation des séquences d’acides nucléiques et d’acides aminés est devenu une nécessité. Ce livre contribuera à une meilleure compréhension des outils à disposition et de leurs principes de fonctionnement et permettra ainsi d’en faire un usage raisonné.&lt;/p&gt;</Text>
        <Text language="eng">&lt;p&gt;&lt;b&gt;This Print On Demand book will be sent within 3 weeks (metropolitan France) and in a separate package if you order another paperback book.&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;At the interface between biology and computer science, bioinformatics and its tools are now part of the "landscape" of laboratories interested in any way whatsoever in the structure, operation and evolution of genomes. Everyone involved now finds it necessary to use tools for analysing, storing and visualising nucleic acid and amino acid sequences. This book will assist in understanding bioinformatics tools and their operating principles better, thereby allowing reasoned use of them.&lt;/p&gt;</Text>
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        <Text>Ce livre contribuera à une meilleure compréhension des outils mis à disposition par la bio-informatique et de leurs principes de fonctionnement et permettra ainsi aux biologistes d'en faire un usage raisonné.</Text>
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        <Text>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Avant-propos&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;G&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 1. Bio-informatique et bio-analyse : d&amp;eacute;finitions&lt;br /&gt;Fiche 2. Quelques g&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s sur les g&amp;egrave;nes et les g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;&amp;nbsp;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Banques et bases de donn&amp;eacute;es en biologie&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 3. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 4. Banques g&amp;eacute;n&amp;eacute;ralistes&lt;br /&gt;Fiche 5. Bases de donn&amp;eacute;es sp&amp;eacute;cialis&amp;eacute;es de g&amp;eacute;nomes complets&lt;br /&gt;Fiche 6. Bases de donn&amp;eacute;es d&amp;eacute;di&amp;eacute;es aux exp&amp;eacute;riences &amp;agrave; grande &amp;eacute;chelle&lt;br /&gt;Fiche 7. Bases de donn&amp;eacute;es d&amp;eacute;di&amp;eacute;es &amp;agrave; des familles de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 8. G&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s sur les outils de recherche, d&amp;#39;analyse et de visualisation&lt;br /&gt;Fiche 9. Outils d&amp;rsquo;interrogation de donn&amp;eacute;es : &lt;em&gt;databank browsers &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Fiche 10. Outils de navigation g&amp;eacute;nomique : &lt;em&gt;genome browsers &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Alignement des s&amp;eacute;quences&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 11. Principes&lt;br /&gt;Fiche 12. Alignements graphiques et programmation dynamique&lt;br /&gt;Fiche 13. BLAST&lt;br /&gt;Fiche 14. Statistiques de BLAST et E-value&lt;br /&gt;Fiche 15. Pi&amp;egrave;ges de BLAST&lt;br /&gt;Fiche 16. Filtrage des s&amp;eacute;quences et recherche de motifs avec BLAST&lt;br /&gt;Fiche 17. Diff&amp;eacute;rentes variantes de BLAST&lt;br /&gt;Fiche 18. FASTA&lt;br /&gt;Fiche 19. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Fiche 20. Principales m&amp;eacute;thodes d&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Fiche 21. Alignement multiple : ClustalW&lt;br /&gt;Fiche 22. Alignement multiple : ClustalW en ligne de commande&lt;br /&gt;Fiche 23. Alignement multiple : DIALIGN&lt;br /&gt;Fiche 24. Alignement multiple : T-Coffee&lt;br /&gt;Fiche 25. Alignement multiple : MUSCLE&lt;br /&gt;Fiche 26. Alignement multiple : MAFFT&lt;br /&gt;Fiche 27. Choix d&amp;rsquo;un logiciel d&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Domaines prot&amp;eacute;iques&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 28. Domaines, modules ou motifs prot&amp;eacute;iques et leurs bases de donn&amp;eacute;es&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Reconstruction phylog&amp;eacute;n&amp;eacute;tique&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 29. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 30. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur les matrices de distances&lt;br /&gt;Fiche 31. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur le principe de parcimonie&lt;br /&gt;Fiche 32. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur le maximum de vraisemblance&lt;br /&gt;Fiche 33. Estimation de la robustesse&lt;br /&gt;Fiche 34. Choix d&amp;rsquo;une m&amp;eacute;thode&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Annotation des g&amp;eacute;nomes&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 35. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 36. Pr&amp;eacute;diction des s&amp;eacute;quences codantes et cha&amp;icirc;nes de Markov&lt;br /&gt;Fiche 37. Annotation structurale, ou syntaxique&lt;br /&gt;Fiche 38. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle&lt;br /&gt;Fiche 39. Limites de l&amp;rsquo;annotation des g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;Fiche 40. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Fiche 41. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico&lt;/em&gt;&amp;nbsp; par recherche d&amp;rsquo;homologies&lt;br /&gt;Fiche 42. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: alignement de paires de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 43. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: alignement multiple de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 44. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: m&amp;eacute;thodes de reconnaissance par repliements&lt;br /&gt;Fiche 45. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: conservation de la fonction et similarit&amp;eacute; de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 46. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: propri&amp;eacute;t&amp;eacute;s intrins&amp;egrave;ques des s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 47. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: exploitation du contexte des g&amp;egrave;nes&lt;br /&gt;Fiche 48. Conclusions sur l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Comparaison des g&amp;eacute;nomes&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 49. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 50. &amp;Eacute;v&amp;eacute;nements de sp&amp;eacute;ciation et de duplication&lt;br /&gt;Fiche 51. Orthologie et paralogie&lt;br /&gt;Fiche 52. Processus de comparaison des g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;Fiche 53. Classification des esp&amp;egrave;ces tenant compte de leur contenu g&amp;eacute;n&amp;eacute;tique&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Analyse du transcriptome&lt;br /&gt;&lt;/strong&gt;Fiche 54. D&amp;eacute;finition des s&amp;eacute;quences sonde pour la PCR et pour les puces &amp;agrave; ADN&lt;br /&gt;Fiche 55. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome&lt;br /&gt;Fiche 56. M&amp;eacute;thodes de l&amp;rsquo;analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome&lt;br /&gt;Fiche 57. Analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome : signification statistique&lt;br /&gt;Fiche 58. Analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome : repr&amp;eacute;sentations graphiques&lt;br /&gt;Pour en savoir plus...&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Coordonn&amp;eacute;es des auteurs&lt;br /&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;</Text>
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        <BiographicalNote language="fre">&lt;p class="MsoNormal"&gt;&lt;b&gt;&lt;span style="font-family:Roboto"&gt;Denis Tagu&lt;/span&gt;&lt;/b&gt;&lt;span style="font-family:Roboto"&gt;, directeur de recherche à l’Inra, s’intéresse au fonctionnement des génomes (notamment ceux des insectes) pour comprendre comment les organismes s’adaptent à leur environnement.&lt;o:p&gt;&lt;/o:p&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
        <BiographicalNote language="eng">&lt;p&gt;Denis Tagu, docteur ès sciences, est directeur de recherches à l'Inra. Il a notamment&lt;br /&gt;développé des ressources génomiques sur les insectes ravageurs des cultures&lt;br /&gt;(les pucerons), nécessitant l’appui d’outils d’analyse de stockage et de visualisation&lt;br /&gt;apportés par la bioinformatique. Il a été coordinateur de Principes des techniques de&lt;br /&gt;biologie moléculaire publié chez Inra Éditions, traduit en anglais, espagnol et chinois.&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
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        <BiographicalNote>&lt;p&gt;Jean-Loup Risler, docteur ès sciences, ex-directeur de recherches au CNRS, a fait ses premières armes au Centre de génétique moléculaire de Gif-sur-Yvette. Il a ensuite étudié la cristallographie des protéines avant de s'orienter, une dizaine d’années plus tard, vers l’analyse in silico des séquences biologiques à Gif-sur-Yvette, puis à Versailles et enfin à Evry.&lt;/p&gt;</BiographicalNote>
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        <Text language="fre">&lt;p&gt;&lt;b&gt;Cet ouvrage en impression à la demande sera envoyé sous 3 semaines environ (France métropolitaine) et dans un colis séparé en cas de commande avec un autre livre papier.&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Située à l'interface entre la biologie et l'informatique, la bio-informatique et ses outils font aujourd'hui partie du « paysage » des laboratoires s’intéressant de près ou de loin à la structure, au fonctionnement et à l’évolution des génomes. Pour tous les intervenants, s’approprier les outils d’analyse, de stockage et de visualisation des séquences d’acides nucléiques et d’acides aminés est devenu une nécessité. Ce livre contribuera à une meilleure compréhension des outils à disposition et de leurs principes de fonctionnement et permettra ainsi d’en faire un usage raisonné.&lt;/p&gt;</Text>
        <Text language="eng">&lt;p&gt;&lt;b&gt;This Print On Demand book will be sent within 3 weeks (metropolitan France) and in a separate package if you order another paperback book.&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;p&gt;At the interface between biology and computer science, bioinformatics and its tools are now part of the "landscape" of laboratories interested in any way whatsoever in the structure, operation and evolution of genomes. Everyone involved now finds it necessary to use tools for analysing, storing and visualising nucleic acid and amino acid sequences. This book will assist in understanding bioinformatics tools and their operating principles better, thereby allowing reasoned use of them.&lt;/p&gt;</Text>
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        <Text>Ce livre contribuera à une meilleure compréhension des outils mis à disposition par la bio-informatique et de leurs principes de fonctionnement et permettra ainsi aux biologistes d'en faire un usage raisonné.</Text>
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        <Text>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;Avant-propos&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;G&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 1. Bio-informatique et bio-analyse : d&amp;eacute;finitions&lt;br /&gt;Fiche 2. Quelques g&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s sur les g&amp;egrave;nes et les g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;&amp;nbsp;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Banques et bases de donn&amp;eacute;es en biologie&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 3. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 4. Banques g&amp;eacute;n&amp;eacute;ralistes&lt;br /&gt;Fiche 5. Bases de donn&amp;eacute;es sp&amp;eacute;cialis&amp;eacute;es de g&amp;eacute;nomes complets&lt;br /&gt;Fiche 6. Bases de donn&amp;eacute;es d&amp;eacute;di&amp;eacute;es aux exp&amp;eacute;riences &amp;agrave; grande &amp;eacute;chelle&lt;br /&gt;Fiche 7. Bases de donn&amp;eacute;es d&amp;eacute;di&amp;eacute;es &amp;agrave; des familles de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 8. G&amp;eacute;n&amp;eacute;ralit&amp;eacute;s sur les outils de recherche, d&amp;#39;analyse et de visualisation&lt;br /&gt;Fiche 9. Outils d&amp;rsquo;interrogation de donn&amp;eacute;es : &lt;em&gt;databank browsers &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Fiche 10. Outils de navigation g&amp;eacute;nomique : &lt;em&gt;genome browsers &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Alignement des s&amp;eacute;quences&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 11. Principes&lt;br /&gt;Fiche 12. Alignements graphiques et programmation dynamique&lt;br /&gt;Fiche 13. BLAST&lt;br /&gt;Fiche 14. Statistiques de BLAST et E-value&lt;br /&gt;Fiche 15. Pi&amp;egrave;ges de BLAST&lt;br /&gt;Fiche 16. Filtrage des s&amp;eacute;quences et recherche de motifs avec BLAST&lt;br /&gt;Fiche 17. Diff&amp;eacute;rentes variantes de BLAST&lt;br /&gt;Fiche 18. FASTA&lt;br /&gt;Fiche 19. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Fiche 20. Principales m&amp;eacute;thodes d&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Fiche 21. Alignement multiple : ClustalW&lt;br /&gt;Fiche 22. Alignement multiple : ClustalW en ligne de commande&lt;br /&gt;Fiche 23. Alignement multiple : DIALIGN&lt;br /&gt;Fiche 24. Alignement multiple : T-Coffee&lt;br /&gt;Fiche 25. Alignement multiple : MUSCLE&lt;br /&gt;Fiche 26. Alignement multiple : MAFFT&lt;br /&gt;Fiche 27. Choix d&amp;rsquo;un logiciel d&amp;rsquo;alignement multiple&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Domaines prot&amp;eacute;iques&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 28. Domaines, modules ou motifs prot&amp;eacute;iques et leurs bases de donn&amp;eacute;es&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Reconstruction phylog&amp;eacute;n&amp;eacute;tique&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 29. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 30. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur les matrices de distances&lt;br /&gt;Fiche 31. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur le principe de parcimonie&lt;br /&gt;Fiche 32. M&amp;eacute;thodes bas&amp;eacute;es sur le maximum de vraisemblance&lt;br /&gt;Fiche 33. Estimation de la robustesse&lt;br /&gt;Fiche 34. Choix d&amp;rsquo;une m&amp;eacute;thode&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Annotation des g&amp;eacute;nomes&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 35. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 36. Pr&amp;eacute;diction des s&amp;eacute;quences codantes et cha&amp;icirc;nes de Markov&lt;br /&gt;Fiche 37. Annotation structurale, ou syntaxique&lt;br /&gt;Fiche 38. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle&lt;br /&gt;Fiche 39. Limites de l&amp;rsquo;annotation des g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;Fiche 40. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Fiche 41. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico&lt;/em&gt;&amp;nbsp; par recherche d&amp;rsquo;homologies&lt;br /&gt;Fiche 42. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: alignement de paires de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 43. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: alignement multiple de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 44. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: m&amp;eacute;thodes de reconnaissance par repliements&lt;br /&gt;Fiche 45. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: conservation de la fonction et similarit&amp;eacute; de s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 46. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: propri&amp;eacute;t&amp;eacute;s intrins&amp;egrave;ques des s&amp;eacute;quences&lt;br /&gt;Fiche 47. Annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;: exploitation du contexte des g&amp;egrave;nes&lt;br /&gt;Fiche 48. Conclusions sur l&amp;rsquo;annotation fonctionnelle &lt;em&gt;in silico &lt;/em&gt;&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Comparaison des g&amp;eacute;nomes&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;Fiche 49. Introduction&lt;br /&gt;Fiche 50. &amp;Eacute;v&amp;eacute;nements de sp&amp;eacute;ciation et de duplication&lt;br /&gt;Fiche 51. Orthologie et paralogie&lt;br /&gt;Fiche 52. Processus de comparaison des g&amp;eacute;nomes&lt;br /&gt;Fiche 53. Classification des esp&amp;egrave;ces tenant compte de leur contenu g&amp;eacute;n&amp;eacute;tique&lt;br /&gt;Pour en savoir plus&amp;hellip;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Analyse du transcriptome&lt;br /&gt;&lt;/strong&gt;Fiche 54. D&amp;eacute;finition des s&amp;eacute;quences sonde pour la PCR et pour les puces &amp;agrave; ADN&lt;br /&gt;Fiche 55. Introduction &amp;agrave; l&amp;rsquo;analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome&lt;br /&gt;Fiche 56. M&amp;eacute;thodes de l&amp;rsquo;analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome&lt;br /&gt;Fiche 57. Analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome : signification statistique&lt;br /&gt;Fiche 58. Analyse statistique des exp&amp;eacute;riences sur le transcriptome : repr&amp;eacute;sentations graphiques&lt;br /&gt;Pour en savoir plus...&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;Coordonn&amp;eacute;es des auteurs&lt;br /&gt;&lt;/strong&gt;&lt;/p&gt;</Text>
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