Chapitre 1. Le sol habitat : environnement physicochimique et conditions de développement des différents organismes présents dans le sol
Le sol, genèse et évolution : création d’un habitat
Implications au plan physicochimique
La structure du sol, habitat pour les êtres vivants
Conclusion
Chapitre 2. Localisation des matières organiques et des activités microbiennes : conséquences pour le fonctionnement du sol
Biodégradation des matières organiques : de multiples facteurs
Les processus à l’échelle microscopique affectent les flux à une échelle macroscopique, voire globale
Conclusion
Chapitre 3. Couplages et contrôles des cycles du carbone et de l’azote par les communautés microbiennes dans les sols cultivés
Les mécanismes mis en jeu
Quelles options envisager pour l’évolution des systèmes cultivés ?
Conclusion
Chapitre 4. La richesse des communautés microbiennes des sols, un trésor inestimable
Les sols, réacteurs bio-physicochimiques
Les sols, réservoirs de microorganismes aux activités multiples
Les microorganismes des sols, clés des recyclages biogéochimiques, agents de fonctions essentielles des sols
Les sols abritent des systèmes biologiques hautement régulés
Les sols, habitats de biosystèmes adaptés
Pourquoi nos connaissances des communautés microbiennes et des conditions de leur activité sont-elles encore si réduites ?
Les connaissances à développer pour mieux valoriser les organismes du sol
et leur potentiel génétique
Conclusion
Chapitre 5. Modélisation de la croissance des cultures considérant l’hétérogénéité physique et spatiale du sol
Expérimentations au champ
Modélisation couplant sols-végétation-atmosphère
Conclusion
Chapitre 6. Impact des invertébrés sur les fonctions des sols et leurs applications dans les systèmes sol-plante
Les sols, milieux vivants
Implications de la faune du sol pour la production primaire
Piloter la biodiversité des sols ?
Chapitre 7. Les relations trophiques microfaune-bactéries rhizosphériques-mycorhizes : quel rôle dans le recyclage des nutriments (N et P) ?
La plante et son environnement biologique dans le sol
Cycle de l’azote et effet des composants biologiques sur la nutrition azotée des plantes
Cycle du phosphore et effet des composants biologiques sur la nutrition phosphatée des plantes
Conclusion
Chapitre 8. Effets en surface avec impacts sous surface : réponse de la rhizosphère d’arbres forestiers à une exposition élevée à l’ozone troposphérique
Effets de l’O3 dans le sol
Interactions O3/sécheresse
Modèle expliquant les effets sols de l’O3
Nouvelles connaissances sur la réaction de l’arbre adulte à l’O3
Signification écologique et conclusions
Chapitre 9. Mise en place d’outils et de bio-indicateurs pertinents de la qualité des sols
Un intérêt croissant pour les sols et leur composante biologique
Des outils classiques complétés par de nouvelles approches
Construction de référentiels d’interprétation
De l’indicateur à la fonction et aux services écosystémiques potentiels
Acceptabilité et compréhension des bio-indicateurs
Sélection d’indicateurs pertinents pour évaluer la qualité des sols
Conclusion
Chapitre 10. Compréhension et valorisation des interactions entre plantes et microorganismes telluriques : des enjeux majeurs en agroécologie
Des progrès majeurs dans les stratégies et les méthodes d’analyse de la biodiversité tellurique et des interactions plantes-microorganismes
Recrutement du microbiote rhizosphérique par la plante hôte
Des interactions à bénéfices réciproques
Les interactions plantes-microorganismes dans les agroécosystèmes
Conclusions et perspectives
Chapitre 11. Les associations mycorhiziennes dans les sols : pour une meilleure maîtrise de la production végétale
La symbiose mycorhizienne
La valorisation de la symbiose mycorhizienne en agriculture
Conclusion
Chapitre 12. Mécanismes cellulaires et moléculaires et ingénierie écologique des mycorhizes à arbuscules
Introduction : mycorhizes à arbuscules et services écosystémiques
Mécanismes sous-jacents aux échanges de nutriments dans la mycorhize à arbuscules
Régulation des protéines de transport impliquées dans les échanges trophiques de la mycorhize à arbuscules
Réseaux mycéliens communs
Ingénierie écologique des mycorhizes à arbuscules
Conclusion
Chapitre 13. Orienter les communautés et populations microbiennes telluriques via l’utilisation de plantes à exsudation modifiée
La rhizosphère, lieu privilégié d’échanges entre microorganismes et végétaux
Orienter les populations et les communautés microbiennes de la rhizosphère*
Vers une nouvelle vision des interactions entre plantes et microorganismes associés
Chapitre 14. Orienter les communautés et les populations microbiennes telluriques via l’utilisation de biostimulants perturbant la communication moléculaire bactérienne
La lutte biologique utilisant les microorganismes du sol
De l’intérêt d’être à l’écoute des communications microbiennes
Comment perturber la communication des bactéries pathogènes ?
Biostimulation de la dégradation des signaux de quorum sensing
Un agent bactérien capable d’une dégradation efficiente des signaux de quorum sensing
Transfert d’échelle et application en sols
Perspectives
Chapitre 15. Défis et perspectives pour l’utilisation de la fixation biologique de l’azote en agriculture
L’addiction de l’agriculture à l’azote
La fixation symbiotique de l’azote, pierre angulaire d’une future agriculture durable
Utilisation d’endophytes diazotrophes comme bio-inoculant
La production de la nitrogénase dans des organites végétaux : les « nitroplastes »
L’organogenèse de nodosités chez des plantes de grande culture
Conclusion
Chapitre 16. Communication entre les partenaires dans la symbiose mycorhizienne à arbuscules
Les strigolactones : des molécules de signalisation aux multiples fonctions
Émission de strigolactones et de Myc-LCO : monologues ou dialogue ?
Conclusions et perspectives
