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Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique

3e édition revue et augmentée

de Denis Tagu (coordination éditoriale), Stéphanie Jaubert-Possamai (coordination éditoriale), Agnès Méreau (coordination éditoriale)
Collection : Savoir faire
novembre 2018
Livre papier
format 160 x 240 312 pages En stock
29,00 €
eBook [ePub]
312 pages En stock
19,99 €
eBook [PDF]
En stock
19,99 €

Cet ouvrage très didactique présente, sous forme de fiches, les principales techniques utilisées dans les laboratoires pour étudier le fonctionnement du vivant via les acides nucléiques. 

Après quelques définitions et généralités sur la structure des gènes, on y décrit les techniques de base en biologie moléculaire et génomique. Ces techniques consistent à extraire les acides nucléiques, à les découper, à récupérer des fragments d’intérêt et à les visualiser. Il s’agit également de les manipuler grâce aux techniques de clonage et de PCR (Polymerase Chain Reaction).

Parmi les applications, le séquençage est une technique qui a grandement évolué ces quinze dernières années et qui n’est toujours pas stabilisée : nous aborderons ici les techniques de séquençage actuellement commercialisées et accessibles via des plateformes publiques ou privées.

Autre application majeure, la manipulation des gènes par transformation génétique et mutagenèse permet une étude fine de leur fonctionnement. Plusieurs techniques de transformation génétique existent dont la nouvelle technique d’édition des génomes (CRISPR-Cas9) qui est décrite dans cet ouvrage.

Enfin, la plupart des approches font maintenant appel à des stratégies dites « haut débit ». L’analyse des données ainsi générées nécessite de recourir à la bioanalyse et à la bioinformatique : cet ouvrage ne vise pas à donner toutes les bases de ces analyses, mais quelques applications y sont détaillées.

Cette 3e édition revue et augmentée s’adresse aux étudiants et aux enseignants, ainsi qu’aux personnels travaillant dans des laboratoires manipulant les acides nucléiques.

Partie 1. Les bases


Fiche1. Structure et expression d’un gène eucaryote codant un ARNm et une protéine

Fiche2. Définition des ARN non codants

Fiche3. Paramètres de description d’un génome

Fiche4. Enzymes de restriction

Fiche5. Électrophorèse des acides nucléiques

Fiche6. PCR (Polymerase Chain Reaction)

Fiche7. Description d’un plasmide et d’un phagemide

Fiche8. Description d’un YAC et autres grands vecteurs

Fiche9. Clonage moléculaire

Fiche10. Transformation génétique des bactéries et des levures

Fiche11. Construction de banques d’acides nucléiques

Fiche12. Extraction d’ADN

Fiche13. Extraction d’ARN

Fiche14. Marquage des acides nucléiques (ADN et ARN)

Fiche15. Hybridation moléculaire

Fiche16. Hybridation in situ d’ARN

Fiche17. La cytogénétique moléculaire : FISH, GISH

Fiche18. Électrophorèse en champ pulsé

 

Partie 2. Caractérisationd’un gène

 

Fiche19. Séquençage d’ADN par la technique Sanger

Fiche20. RT-PCR (Reverse Transcription -Polymerase Chain Reaction)

Fiche21. PCR quantitative

Fiche22. Amplification rapide d’extrémités d’ADNc : RACE

Fiche23. Transcription in vitro

Fiche24. Détermination du site d’initiation de la transcription

Fiche25. Gel-retard

Fiche26. Production de protéines recombinantes

Fiche27. Système du double hybride

 

Partie 3. Analyse de lafonction d’un gène par mutagenèse ou transgenèse

 

Fiche28. Grands principes de la transgenèse et de la mutagenèse

Fiche29. Transfert de gènes

Fiche30. Transgenèse chez la souris

Fiche31. Analyse de la fonction d’un gène par mutagenèse ou transgenèse chez les poissons

Fiche32. Transgenèse chez Drosophilamelanogaster

Fiche33. Transgenèse de Caenorhabditis elegans

Fiche34. Transgenèse stable des plantes par les agrobactéries

Fiche35. Techniques de ARNi (ARN interférence)

Fiche36. Transformation des plantes par agro-infiltration par Agrobacterium tumefaciens

Fiche37. Analyse fonctionnelle de promoteurs

Fiche38. Mutagenèse chimique du génome de drosophile

Fiche 39. Mutagenèse d’insertion

Fiche 40. Le TILLING (Targeting-Induced Local Lesions IN Genomes)

Fiche41. Mutagenèse dirigée par le système CRISPR-Cas9

 

Partie 4. Approches hautdébit

 

Fiche42. Séquencer un génome : généralités

Fiche43. Séquençage d’ADN par la technique Illumina

Fiche44. Séquençage d’ADN par la technique SingleMolecule Real Time (SMRT) : PacBio

Fiche45. Séquençage d’ADN grande longueur par la technique Nanopore

Fiche46. Séquençage d’ADN par la technique Ion Torrent™

Fiche47. Séquençage d’ADN grande longueur « synthétique » par la technique 10XGenomics®

Fiche48. Cartographie optique de génomes (OpticalMapping)

Fiche49. La capture d’exons

Fiche50. Métagénomique et métatranscriptomique

Fiche51. Barcoding et métabarcoding

Fiche52. Analyse des données RNA-seq (RNA-sequencing)

Fiche53. Interactions protéines-ARN à la résolution du nucléotide (iCLIP) 

Fiche54. Méthodes d’analyse du traductome

Fiche55. Structure de la chromatine : introduction

Fiche56. Immunoprécipitation de la chromatine (ChIP)

Fiche57. Analyse tridimensionnelle de la chromatine par Chromosome Conformation Capture : les techniques 3C, 4C-seq et Hi-C

Fiche58. Techniques d’identification de régions génomiques accessibles à desrégulateurs : FAIRE et ATAC

Fiche59. Méthode de détermination du positionnement des nucléosomes : MAINE

Fiche60. La méthylation de l’ADN

 

Partie 5. Étude dupolymorphisme d’un génome

 

Fiche61. Les principaux types de polymorphisme

Fiche62. Microsatellites, répétitions de séquences simples : SSR

Fiche63. Génotypage SNP (Single NucleotidePolymorphism)

Fiche64. Utilisation des polymorphismes : QTL, GWAS et scans génomiques

Fiche65. Détermination du polymorphisme par séquençage de nouvelle génération

Fiche66. Approches populationnelles par séquençage en pools (Pool-Seq)

Fiche67. Détection génomique de CNV par nouvelles technologies de séquençage

Fiche68. Étude du polymorphisme par séquençage d’ADN associé à des sites derestriction (RAD-seq)

Fiche69. Génotypage par séquençage : GBS (GenotypingBy Sequencing)

 

Partie 6. Bioanalyses

 

Fiche70. Assemblage de génomes

Fiche71. Annotation de génomes

Fiche72. Galaxy

Fiche73. La programmation

La photosynthèse Processus physiques, moléculaires et physiologiques

Livre papier 49,00 €

Jack Farineau, Jean-François Morot-Gaudry

Amélioration génétique Numéro spécial Inra productions animales

Brochure 25,00 €

De la domestication à la transgénèse Évolution des outils pour l’amélioration des plantes

Livre papier 15,00 €

André Gallais

Réussir le tempérage du chocolat Les clés d'un savoir-faire

Livre papier 35,00 €

Isabelle Christian

Guide des analyses en pédologie 3e édition revue et augmentée

Livre papier 35,00 €

Denis Baize

Gestion de la santé des poissons

Livre papier 39,00 €

De l’analyse des réseaux expérimentaux à la méta-analyse Méthodes et applications avec le logiciel R pour les sciences agronomiques et environnementales

Livre papier 25,00 €

David Makowski, François Piraux, François Brun

Nutrition minérale des ruminants Nouvelle édition

eBook 21,99 €

François Meschy

Les sols Intégrer leur multifonctionnalité pour une gestion durable

Livre papier 45,00 €

Le lapin De la biologie à l'élevage

Livre papier 35,00 €

Thierry Gidenne

Les animaux et le sexe 60 clés pour comprendre

Livre papier 18,00 €

Matthieu Keller

Biomimétisme Il y a du génie dans la nature !

Livre relié 28,00 €

Jean-Philippe Camborde

La Nanorévolution Comment les nanotechnologies transforment déjà notre quotidien

Livre papier 19,00 €

Azar Khalatbari

Pollinisation Le génie de la nature

Livre papier 22,00 €

Vincent Albouy

Les sols ont-ils de la mémoire ? 80 clés pour comprendre les sols

Livre papier 20,00 €

Jérôme Balesdent, Etienne Dambrine, Jean-Claude Fardeau

Comprendre l'amélioration des plantes Enjeux, méthodes, objectifs et critères de sélection

Livre papier 24,00 €

André Gallais

Langue(s) : Français

Editeur : Éditions Quae

Edition : 3e édition

Collection : Savoir faire

Publication : 1 novembre 2018

EAN13 eBook [ePub] : 9782759228874

EAN13 eBook [PDF] : 9782759228867

EAN13 Livre papier : 9782759228850

Référence eBook [ePub] : 02656EPB

Référence eBook [PDF] : 02656NUM

Référence Livre papier : 02656

Intérieur : Bichromie

Format (en mm) Livre papier : 160 x 240

Nombre de pages eBook [ePub] : 312

Nombre de pages eBook [PDF] :

Nombre de pages Livre papier : 312

Poids (en grammes) : 570 (Livre papier)

Taille(s) : 10 Mo (ePub), 11 Mo (PDF)

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