La métagénomique

Développements et futures applications

de Marie Christine Champomier-Vergès (coordination scientifique), Monique Zagorec (coordination scientifique)
Collection : Savoir faire
février 2015
Livre papier
format [NR] 120 pages En stock
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Présentation

Cet ouvrage en impression à la demande sera envoyé sous 3 semaines environ (France métropolitaine) et dans un colis séparé en cas de commande avec un autre livre papier.

Après l’ère de la génomique, la métagénomique a envahi le domaine de la biologie. Permettant l’exploration du contenu génétique d’un échantillon issu d’un environnement complexe (sol, eau, végétal, microbiote animal, aliment, etc.), via le séquençage de l’ADN, la métagénomique repousse les limites imposées par la culture en milieu de laboratoire. Elle se caractérise par une production rapide et massive de données, et des traitements informatiques conséquents afin d’en retirer une information exploitable.

Cet ouvrage fait le point sur les différentes technologies et les méthodes de production et d’analyses de données actuellement disponibles dans ce domaine. Il présente un panel des champs d’applications — agriculture, environnement, agroalimentaire et santé — qui bénéficient de l’apport de ces techniques pour mieux décrypter la diversité du monde vivant microbiologique.

Il permettra aux étudiants, enseignants, chercheurs ou ingénieurs, quelle que soit leur spécialité en sciences de la vie ou de la Terre, de comprendre ces nouvelles approches, leurs mises en œuvre et leurs limites.

Sommaire

Avant-propos

 

Chapitre 1. Techniques et matériels pour la production des données brutes de séquençage métagénomique

Introduction

Design expérimental et échantillonnage

Préparation des échantillons et extraction des acides nucléiques

Le séquençage à haut débit

Les banques de clones d’ADN métagénomique

Conclusion

Références bibliographiques

 

Chapitre 2. Analyse des données, logiciels, transformation des data en information, utilisation et modélisation des données

Introduction

Assemblage

Assignation taxonomique

Classification non supervisée

Prédiction de parties codantes

Analyse fonctionnelle

Intégration des outils

Références bibliographiques

 

Chapitre 3. Découverte de nouvelles fonctions et familles protéiques : nouveaux défis pour les biotechnologies et l’écologie microbienne

Introduction

Stratégies d’échantillonnage

Le criblage fonctionnel : nouveaux défis pour la découverte de fonctions

Conclusion

Références bibliographiques

 

Chapitre 4. Microbiote intestinal et typage

Introduction

Métagénome du microbiote intestinal humain

Dysfonctions du microbiome intestinal et pathologies

Conclusion

Références bibliographiques

 

Chapitre 5. Communautés microbiennes des aliments

Introduction

Les techniques à haut débit ciblées pour approfondir la connaissance des communautés microbiennes des aliments

Exemples d’études métagénomiques sur des aliments

Conclusion et perspectives

Références bibliographiques

 

Chapitre 6. Microbiome du sol

Introduction

Exploration et exploitation des ressources génétiques de sols modèles

Biogéographie et gestion des communautés microbiennes des sols

Conclusion et perspectives

Références bibliographiques

 

Chapitre 7. Métagénomique environnementale

Des gènes aux génomes

Communautés microbiennes complexes

L’exemple des écosystèmes arséniés

Conclusion et perspectives

Références bibliographiques

 

Chapitre 8. Microbiomes de la phyllosphère

Introduction

La phyllosphère, un habitat extrême pour les micro-organismes

Premières études métagénomiques

Une mine de données génomiques à explorer

Limites de l’approche métagénomique

Promesses de l’étude métagénomique des microbiomes de phyllosphère

Références bibliographiques

 

Synthèse et perspectives

L’apport de l’évolution de la technologie de séquençage

La caractérisation des écosystèmes de domaines très variés

Les différentes facettes de l’exploration du vivant par la métagénomique

Les limites de la métagénomique

Les défis futurs

 

Liste des auteurs

Lu dans la presse

Annonce

Caractéristiques

Langue(s) : Français

Editeur : Éditions Quae

Edition : 1ère édition

Collection : Savoir faire

Publication : 6 février 2015

Référence Livre papier : 02474

Référence eBook [ePub] : 02474EPB

Référence eBook [PDF] : 02474NUM

EAN13 Livre papier : 9782759222933

EAN13 eBook [ePub] : 9782759222957

EAN13 eBook [PDF] : 9782759222940

Intérieur : Bichromie

Format (en mm) Livre papier : [NR]

Nombre de pages Livre papier : 120

Nombre de pages eBook [PDF] : 120

Poids (en grammes) : 228

Taille(s) : 1,6 Mo (ePub), 2,3 Mo (PDF)

Vidéo

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