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La métagénomique

Développements et futures applications

de Marie Christine Champomier-Vergès (coordination éditoriale), Monique Zagorec (coordination éditoriale)
Collection : Savoir faire
février 2015
Livre papier
format [NR] 120 pages En stock
27,00 €
eBook [ePub]
format [NR] En stock
17,99 €
eBook [PDF]
format [NR] En stock
17,99 €

Après l’ère de la génomique, la métagénomique a envahi le domaine de la biologie. Permettant l’exploration du contenu génétique d’un échantillon issu d’un environnement complexe (sol, eau, végétal, microbiote animal, aliment, etc.), via le séquençage de l’ADN, la métagénomique repousse les limites imposées par la culture en milieu de laboratoire. Elle se caractérise par une production rapide et massive de données, et des traitements informatiques conséquents afin d’en retirer une information exploitable.

Cet ouvrage fait le point sur les différentes technologies et les méthodes de production et d’analyses de données actuellement disponibles dans ce domaine. Il présente un panel des champs d’applications — agriculture, environnement, agroalimentaire et santé — qui bénéficient de l’apport de ces techniques pour mieux décrypter la diversité du monde vivant microbiologique.

Il permettra aux étudiants, enseignants, chercheurs ou ingénieurs, quelle que soit leur spécialité en sciences de la vie ou de la Terre, de comprendre ces nouvelles approches, leurs mises en œuvre et leurs limites.

Avant-propos

 

Chapitre 1. Techniques et matériels pour la production des données brutes de séquençage métagénomique

Introduction

Design expérimental et échantillonnage

Préparation des échantillons et extraction des acides nucléiques

Le séquençage à haut débit

Les banques de clones d’ADN métagénomique

Conclusion

Références bibliographiques

 

Chapitre 2. Analyse des données, logiciels, transformation des data en information, utilisation et modélisation des données

Introduction

Assemblage

Assignation taxonomique

Classification non supervisée

Prédiction de parties codantes

Analyse fonctionnelle

Intégration des outils

Références bibliographiques

 

Chapitre 3. Découverte de nouvelles fonctions et familles protéiques : nouveaux défis pour les biotechnologies et l’écologie microbienne

Introduction

Stratégies d’échantillonnage

Le criblage fonctionnel : nouveaux défis pour la découverte de fonctions

Conclusion

Références bibliographiques

 

Chapitre 4. Microbiote intestinal et typage

Introduction

Métagénome du microbiote intestinal humain

Dysfonctions du microbiome intestinal et pathologies

Conclusion

Références bibliographiques

 

Chapitre 5. Communautés microbiennes des aliments

Introduction

Les techniques à haut débit ciblées pour approfondir la connaissance des communautés microbiennes des aliments

Exemples d’études métagénomiques sur des aliments

Conclusion et perspectives

Références bibliographiques

 

Chapitre 6. Microbiome du sol

Introduction

Exploration et exploitation des ressources génétiques de sols modèles

Biogéographie et gestion des communautés microbiennes des sols

Conclusion et perspectives

Références bibliographiques

 

Chapitre 7. Métagénomique environnementale

Des gènes aux génomes

Communautés microbiennes complexes

L’exemple des écosystèmes arséniés

Conclusion et perspectives

Références bibliographiques

 

Chapitre 8. Microbiomes de la phyllosphère

Introduction

La phyllosphère, un habitat extrême pour les micro-organismes

Premières études métagénomiques

Une mine de données génomiques à explorer

Limites de l’approche métagénomique

Promesses de l’étude métagénomique des microbiomes de phyllosphère

Références bibliographiques

 

Synthèse et perspectives

L’apport de l’évolution de la technologie de séquençage

La caractérisation des écosystèmes de domaines très variés

Les différentes facettes de l’exploration du vivant par la métagénomique

Les limites de la métagénomique

Les défis futurs

 

Liste des auteurs

Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique 3e édition revue et augmentée

Livre papier 29,00 €

Réussir le tempérage du chocolat Les clés d'un savoir-faire

Livre papier 35,00 €

Isabelle Christian

Guide des analyses en pédologie 3e édition revue et augmentée

Livre papier 35,00 €

Denis Baize

Gestion de la santé des poissons

Livre papier 39,00 €

De l’analyse des réseaux expérimentaux à la méta-analyse Méthodes et applications avec le logiciel R pour les sciences agronomiques et environnementales

Livre papier 25,00 €

David Makowski, François Piraux, François Brun

Nutrition minérale des ruminants Nouvelle édition

eBook 21,99 €

François Meschy

Les sols Intégrer leur multifonctionnalité pour une gestion durable

Livre papier 45,00 €

Langue(s) : Français

Editeur : Éditions Quae

Edition : 1ère édition

Collection : Savoir faire

Publication : 6 février 2015

EAN13 Livre papier : 9782759222933

EAN13 eBook [ePub] : 9782759222957

EAN13 eBook [PDF] : 9782759222940

Référence Livre papier : 02474

Référence eBook [ePub] : 02474EPB

Référence eBook [PDF] : 02474NUM

Format (en mm) Livre papier : [NR]

Nombre de pages Livre papier : 120

Nombre de pages eBook [ePub] :

Nombre de pages eBook [PDF] :

Poids (en grammes) : 228 (Livre papier)

Taille(s) : 1,6 Mo (ePub), 2,3 Mo (PDF)

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